Komisia je hlavným iniciátorom komunitárnych aktov (smernice, nariadenia, rozhodnutia, medzinárodné dohody). Komisia navrhuje legislatívu z vlastného rozhodnutia, alebo k tomu môže byť vyzvaná Radou či Parlamentom. Lisabonská zmluva zaviedla inštitút „občianskej iniciatívy“, na základe ktorého môže milión občanov z určeného minimálneho počtu krajín (9) vyzvať Komisiu na predloženie návrhu legislatívy.

Komisia môže v ktorejkoľvek fáze procesu prijímania legislatívy svoj návrh upraviť, alebo stiahnuť.